Tổng cục Thuế nhận được công văn của Cục Thuế tỉnh Bình Dương vướng mắc về thuế TNDN. Về vấn đề này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

1. Về chính sách thuế TNDN qua các thời kỳ

- Giai đoạn 2007-2008:

+Tại điểm 19 Mục V Phần A Ban hành kèm theo Nghị định số 108/2006/NĐ-CP quy định hoạt động “Đầu tư xây dựng, kinh doanh kết cấu hạ tầng khu công nghiệp, khu chế xuất, khu công nghệ cao, khu kinh tế và các dự án quan trọng do Thủ tướng Chính phủ quyết định” thuộc danh mục lĩnh vực đặc biệt ưu đãi đầu tư.

+ Tại điểm 2 và điểm 3 công văn số 4125/BTC-TCT ngày 23/3/2009 của Bộ Tài chính về thu thuế thu nhập đối với hoạt động chuyển quyền thuê đất trong KCN, KCX:...

+ Điểm h khoản 3 Mục II Phần B Thông tư số 134/2007/TT-BTC quy định Đối với hoạt động cho thuê tài sản:...

+ Điểm 2.20 Mục III Phần B Thông tư số 134/2008/TT-BTC quy định Các khoản chi phí trích trước mà thực tế không chi:...

- Giai đoạn 2009-2011:

+ Tại điểm 3.5 mục III Phần C Thông tư số 130/2008/TT-BTC quy định Thu nhập từ chuyển nhượng bất động sản:...

+ Điểm 2.18 Mục IV Phần C Thông tư số 130/2008/TT-BTC quy định Các khoản chi phí trích trước theo chu kỳ mà đến hết chu kỳ chưa chi:...

- Giai đoạn 2012-2013:

+ Khoản 2 Điều 16 Thông tư số 123/2012/TT-BTC quy định Thu nhập từ hoạt động chuyển nhượng bất động sản:...

+ Điểm a.2 Khoản 1 Điều 17 Thông tư số 123/2012/TT-BTC quy định Doanh thu để tính thu nhập chịu thuế:...

+ Điểm 2.18 Khoản 2 Điều 6 Thông tư số 123/2012/TT-BTC quy định Các khoản chi phí trích trước theo chu kỳ mà đến hết chu kỳ chưa chi:...

- Giai đoạn từ 2014 đến nay:

+ Khoản 2 Điều 16 Thông tư số 78/2014/TT-BTC quy định Thu nhập từ hoạt động chuyển nhượng bất động sản:...

+ Điểm a.2 Khoản 1 Điều 17 Thông tư số 78/2014/TT-BTC quy định Doanh thu để tính thu nhập chịu thuế:...

+ Điểm 2.20 Khoản 2 Điều 6 Thông tư số 78/2014/TT-BTC đã được sửa đổi, bổ sung tại Điều 4 Thông tư số 96/2015/TT-BTC về Các khoản trích trước:...

...(Xem chi tiết tại văn bản)...

- Về việc thay đổi phương pháp tính thuế:

Tại công văn xin ý kiến của Cục Thuế tỉnh Bình Dương chưa nêu cụ thể vướng mắc phát sinh trong quá trình thanh tra, kiểm tra nên Tổng cục Thuế không có cơ sở trả lời cụ thể. Do đó, đề nghị Cục thuế tỉnh Bình Dương căn cứ tình hình thực tế tại doanh nghiệp và quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật về thuế để thực hiện việc thanh tra, kiểm tra theo đúng quy định của pháp luật

- Đối với đề xuất của Cục Thuế tỉnh Bình Dương về việc tạm nộp thuế theo tỷ lệ %/doanh thu:

Theo quy định tại tiết a điểm 1.1 mục Phần G Thông tư số 130/2008/TT-BTC, điểm a Khoản 1 Điều 17 Thông tư số 123/2012/TT-BTC và điểm ai Khoản 1 Điều 17 Thông tư số 78/2014/TT-BTC thì việc tạm nộp thuế theo tỷ lệ %/doanh thu thu được tiền áp dụng trong trường hợp:...

...(Xem chi tiết tại văn bản)...

Căn cứ vào quy định nêu trên thì chỉ trong trường hợp doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư cơ sở hạ tầng, nhà để chuyển nhượng hoặc cho thuê, có thu tiền ứng trước của khách hàng theo tiến độ nhưng chưa đủ điều kiện ghi nhận doanh thu (chưa bàn giao bất động sản cho bên mua) mới áp dụng quy định tạm nộp thuế TNDN theo tỷ lệ %/doanh thu thu được tiền. Còn trường hợp doanh nghiệp kinh doanh cơ sở hạ tầng cho thuê lại đất trong KCN thì đã ghi nhận doanh thu (đã bàn giao đất cho bên thuê), chỉ là lựa chọn phương pháp ghi nhận doanh thu một lần hay phân bổ theo thời gian cho thuê; vì vậy không thuộc trường hợp được áp dụng quy định tạm nộp thuế TNDN theo tỷ lệ %/doanh thu thu được tiền tại các Thông tư số 130/2008/TT-BTC, Thông tư số 123/2012/TT-BTC và Thông tư số 78/2014/TT-BTC Của Bộ Tài chính.

2. Liên quan đến việc thanh tra, kiểm tra

Tại điểm d khoản 1 Điều 80 Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 quy định:

“Điều 80. Nhiệm vụ, quyền hạn của thủ trưởng cơ quan quản lý thuế ra quyết định kiểm tra thuế và công chức quản lý thuế trong việc kiểm tra thuế:...

Căn cứ quy định trên, thủ trưởng cơ quan quản lý được ban hành Quyết định xử lý về thuế theo thẩm quyền.

Theo công văn của Cục Thuế tỉnh Bình Dương và tài liệu kèm theo, Cục Thuế tỉnh Bình Dương đã tiến hành thanh tra thuế năm 2007-2016 tại Công ty TNHH Xây dựng và Đầu tư Đại Đăng và đã có Biên bản thanh tra thuế tại Công ty. Do đó đề nghị Cục Thuế tỉnh Bình Dương kiểm tra rà soát tình hình thực tế có Công ty và căn cứ quy định của pháp luật về quản lý thuế, quy định của pháp luật thuế TNDN và các văn bản hướng dẫn thi hành áp dụng trong từng thời kỳ để xử lý theo đúng quy định và chịu trách nhiệm về kết quả xử lý của Cục Thuế.

(Ngoài ra, căn cứ theo hồ sơ kèm theo thì Cục trưởng Cục Thuế tỉnh Bình Dương đã ban hành Quyết định số 7053/QĐ-CT ngày 23/11/2017 về việc thanh tra thuế tại Công ty TNHH Xây dựng và Đầu tư Đại Đăng, do đó đề nghị Cục thuế tỉnh Bình Dương lưu ý về thời hạn thanh tra, kiểm tra để xử lý theo đứng quy định.)