Trả lời Công ty cổ phần đầu tư HD vướng mắc về chính sách thuế, Cục Thuế TP Hà Nội có ý kiến như sau:

- Căn cứ Nghị định 126/2020/NĐ-CP quy định chi tiết một số điều của Luật quản lý thuế (có hiệu lực từ ngày 05/12/2020):

+ Tại điểm d khoản 2 Điều 7 quy định lập hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng: ...

+ Tại điểm b khoản 4 Điều 7 quy định khai bổ sung: ...

+ Tại điểm a khoản 1 Điều 11 quy định địa điểm nộp hồ sơ: ...

- Căn cứ Thông tư số 130/2016/TT-BTC sửa đổi một số điều tại các Thông tư về thuế:

+ Tại khoản 3 Điều 1 sửa đổi, bổ sung Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC quy định lập hồ sơ khai thuế riêng cho dự án đầu tư: ...

- Thực hiện theo hướng dẫn tại công văn 944/TCT-CS ngày 01/4/2021 của Tổng cục Thuế hướng dẫn các cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương về hoàn thuế GTGT: ...

- Thực hiện công văn số 2291/TCT-CS ngày 24/6/2021 của Tổng cục Thuế hướng dẫn Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương về việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư khác tỉnh, thành phố: ...

- Thực hiện hướng dẫn tại công văn 1938/BTC-TCT ngày 26/2/2021 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện Thông tư số 156/2013/TT-BTC và các Thông tư khác.

- Căn cứ Điều 49 Thông tư số 156/2013/TT-BTC hướng dẫn Hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng: ...

...(Xem chi tiết tại văn bản)...

- Căn cứ Thông tư số 80/2021/TT-BTC hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Quản lý thuế và Nghị định số 126/2020/NĐ-CP (hiệu lực thi hành từ 01/01/2022):

+ Tại Điều 28 hướng dẫn hồ sơ đề nghị hoàn thuế giá trị gia tăng:

“Điều 28. Hồ sơ đề nghị hoàn thuế giá trị gia tăng

Hồ sơ đề nghị hoàn thuế giá trị gia tăng theo quy định của pháp luật về thuế giá trị gia tăng (trừ trường hợp hoàn thuế giá trị gia tăng theo Điều ước quốc tế; hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết khi chuyển đổi sở hữu, chuyển đổi doanh nghiệp, sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, giải thể, phá sản, chấm dứt hoạt động thực hiện theo quy định tại Điều 30, Điều 31 Thông tư này) gồm:

1. Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước theo mẫu số 01/HT ban hành kèm theo phụ lục I Thông tư này.

2. Các tài liệu có liên quan theo trường hợp hoàn thuế, cụ thể như sau:

a) Trường hợp hoàn thuế dự án đầu tư:

a.1) Bản sao Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc Giấy chứng nhận đầu tư hoặc Giấy phép đầu tư đối với trường hợp phải làm thủ tục cấp giấy chứng nhận đăng ký đầu tư;

a.2) Đối với dự án có công trình xây dựng: Bản sao Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất hoặc quyết định giao đất hoặc hợp đồng cho thuê đất của cơ quan có thẩm quyền; giấy phép xây dựng;

a.3) Bản sao Chứng từ góp vốn điều lệ;

a.4) Bản sao Giấy phép kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện; Giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện; Văn bản của cơ quan nhà nước có thẩm quyền cho phép đầu tư kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện theo quy định tại điểm c khoản 2 Điều 10 Nghị định số 209/2013/NĐ-CP (được sửa đổi, bổ sung tại Khoản 6 Điều 1 Nghị định số 100/2016/NĐ-CP);

a.5) Bảng kê hóa đơn, chứng từ hàng hóa, dịch vụ mua vào theo mẫu số 01-1/HT ban hành kèm theo phụ lục I Thông tư này, trừ trường hợp người nộp thuế đã gửi hóa đơn điện tử đến cơ quan thuế;

a.6) Quyết định thành lập Ban Quản lý dự án, Quyết định giao quản lý dự án đầu tư của chủ dự án đầu tư, Quy chế tổ chức và hoạt động của chi nhánh hoặc Ban quản lý dự án đầu tư (nếu chi nhánh, Ban quản lý dự án thực hiện hoàn thuế).

…”

Căn cứ quy định trên, trường hợp Công ty cổ phần đầu tư HD đã đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới tại địa bàn tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động có số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư mới sau khi bù trừ chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư (trừ các trường hợp thuộc đối tượng không được hoàn thuế theo quy định) theo hướng dẫn tại khoản 3 Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC.

Công ty cổ phần đầu tư HD thực hiện kê khai, hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư tại nơi có dự án đầu tư theo quy định tại Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP.

Về hồ sơ hoàn thuế: Công ty cổ phần đầu tư HD thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 49 Thông tư số 156/2013/TT-BTC. Từ ngày 01/01/2022, Công ty thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 28 Thông tư số 80/2021/TT-BTC.